لم تحدد اسباب التي وراء المرض إلا انه تم الترجيح انه من الممكن ان يولد هذا المرض مع الفرد وراثياً بسبب جين وراثي و قد ينشأ بسبب عوامل باكرة مثل الضغوط الشديدة اثناء الطفولة من المرجح ايضاً ان يكون هنالك اضطراباً في وظائف النواقل العصبية في الدماغ مثل ( الدوبامين و الجلوتامات ) على كل حال ان هنالك شيئاً شبه مؤكد عن طريق دراسات تقول ان مرض انفصام الشخصية هو مرض دماغي المنشأ النتيجة التي جاءت بعد دراسة على اختلافات في بنية الدماغ و الجهاز العصبي لدى مرضى الانفصام .