قد تكون اسباب عسر الهضم تناول كميات زائده من الطعام أو تناول الطعام بسرعه وكذلك تناول الاطعمه ذات كميات كبيره من الدهون ومن مسببات هذا الالم هي تناول بعض المضادات الحيويه ومسكنات الالم ومكملات الحديد, الفرط في أستهلاك الكافيين والكحول والشوكولاته او المشروبات الغازيه ,التدخين ,التوتر او الضغط النفسي وقد يرتبط عسر الهضم بأضطرابات صحيه عديده منها التهاب المعده أو القرحه الهضميه أوالداء البطني ( وهو عباره عن أضطراب مناعي ينتج عنه الحساسيه لبروتين الجروتين وهو بروتين الموجود في القمح والشعير أو حصى المراره أو الامساك أو التهاب البنكرياس أو سرطان المعده أو أنسداد الامعاء أو أنخفاض الترويه الدمويه للآمعاء و من أهم أسباب عسر الهضم هو أضطراب في عمل المعده الميكانيكي الحركي وخاصة تأخر وبطء أخلاء الطعام من المعده ( الامساك ) خلل في نظام تأقلم وملائمة المعده للغذاء الداخل البها فرط حساسيبة المعده في كل ما يتعلق ببث الشعور بالالم وفي بعض الاحيان تلوث تسببه جرثومه الملويه البوابيه وكذلك عوامل نفسيه مثل الميل الى الاكتئاب او الميل الى القلق مما يمكن ان يتفاقم الشعور بالمرض