يعتبر علاج سرطان الخلايا القاعدية سهلاً نسبيًّا، إذا تم اكتشافه في مراحل مبكرة؛ لكن لدى 5-10% من الحالات، تكون الأورام حصينة من العلاج، أو تكون عنيفة بشكل موضعي، وتسبب أضرارًا للجلد المحيط بها، وفي أحيان أخرى ينتشر الورم إلى العظم أو الغضروف (Cartilage). في حال لم يكن العلاج سريعًا يصعب القضاء عليه. إن من حسن الحظ، أن هذا السرطان بنسبة منخفضة من الانتشار وإرسال النقائل الورمية (Metastasis)، وبالرغم من قدرته على التسبب بالندب (Scar) والدمامة، إلا أنه لا يهدد الحياة.