الهدف من علاج القرحة هو تخفيف الألم ، وشفاء القرحة، ومنع حدوث مضاعفات، الخطوة الأولى في العلاج تنطوي على الحد من عوامل الخطر "المسكنات والسجائر"، الخطوة التالية هي الأدوية مضادات الحموضة : مضادات الحموضة تحييد الحامض الموجود في المعدة، مضادات الحموضة مثل مالوكس ، ميلانتا ، هي علاجات آمنة وفعالة، ومع ذلك ، فإن العمل على تحييد هذه العوامل قصيرة الأجل ، يتطلب جرعات متكررة، مضادات الحموضة التي تحتوي على المغنيسيوم ، مثل مالوكس وميلانتا، يمكن أن تسبب الإسهال ، بينما هناك أنواع يمكن أن يسبب الإمساك، القرحة كثيرًا ما تعود عندما توقف مضادات الحموضة حاصرات H2 : وأظهرت الدراسات أن بروتين يطلق في المعدة يسمى الهيستامين يحفز إفراز حمض المعدة، مضادات الهيستامين حاصرات H2" هي الأدوية المصممة لمنع عمل الهستامين على خلايا المعدة وتقلل من إنتاج الحمض، أمثلة من حاصرات H2هي سيميتيدين "تاجميت"، رانيتيدين "زانتاك" ، نيزاتيدين ، و فاموتيدين "بيبسيد". بينما حاصرات H2 فعالة في شفاء القرحة ، لديهم دور محدود في القضاء اتش بيلوري من دون المضادات الحيوية ، لذا القرحة كثيرًا ما تعود عندما يتم إيقاف حاصرات H2 مثبطات مضخة البروتون : مثبطات مضخة البروتون مثل أوميبرازول "برايلوزيك" ، لانزوبرازول ، بانتوبرازول ، إيسوميبرازول "نيكسيوم" ، و الرابيبرازول أكثر فعالية من حاصرات H2 في قمع إفراز الحمض ، مختلف مثبطات مضخة البروتون هي مشابهة جدًا في العمل وليس هناك دليل على أن واحد هو أكثر فعالية من غيرها في شفاء القرحة، بينما مثبطات مضخة البروتون قابلة للمقارنة مع حاصرات H2 في فعالية علاج قرحة المعدة والإثنى عشر ، فهي متفوقة على حاصرات H2 في علاج قرحة المريء، قرحة المريء هي أكثر حساسية من قرحة المعدة والإثنى عشر لكميات ضئيلة من الحمض .